A l’IFP, toutes les actions sont menées au sein de projets. Chacun d’entre eux a des objectifs précis, définis en fonction des missions de l'IFP, de ses priorités stratégiques, et des attentes des industriels et des pouvoirs publics.
Chaque projet est supervisé par un chef de projet. Celui-ci anime une équipe pluridisciplinaire de chercheurs issus des directions de recherche de l’IFP. Les multiples compétences des équipes de l’IFP sont ainsi utilisées avec une grande souplesse et un maximum d’efficacité, l'association des talents étant source d'innovation.
Cette organisation matricielle des programmes de recherche et développement permet à l'IFP de maîtriser le fonctionnement par projets des appels d'offres de l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) et de la Commission européenne (Programme Cadre de Recherche et Développement – PCRD).
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